Se fundó el 1 de marzo de 1958 como "Club Deportivo Independiente" en Sangolquí, Ecuador. Concebido inicialmente para disputar torneos amateur y cantonales. En 1977 se rebautiza como "Independiente José Terán" en homenaje a su fallecido fundador, primer capitán y presidente. Consigue establecerse en los torneos de segunda categoría de la Provincia de Pichincha entre los años 1970 y 1980. Su transitar en esa división no tenía mayor suceso hasta que su nueva administración desde 2006 consiguió una transformación que hizo al club meteóricamente alcanzar la Serie B de los torneos ecuatorianos de fútbol en 2008 y la primera división en 2010, basada en fomentar una inagotable cantera de futbolistas. En 2016 jugó la final de Copa Libertadores, en 2019 conquistó la Copa Sudamericana y en 2021 logró su primer torneo nacional.